농수산물은 부가세 면세품목이지만, 사업자가 농수산물을 사업용으로 사용하면 해당 농수산물의 구매가격에 대한 부가가치세를 의제매입세액으로 계산하여 세액공제하는 제도가 적용됩니다. 즉, 농수산물 거래를 통한 부가세 부담을 줄일 수 있습니다.

음식점을 영업하시는데 사업용 신용카드로 식자재마트에서 농수산물을 구매하셨고, 신용카드 매입세액공제에서 식자재마트 농수산물 구매내역이 선택불공제에서 불공제로 선택되어 있다고 하셨습니다.

신용카드 매입세액공제 변경에서 해당 건을 선택 가능하게 하여 공제로 변경하실 수 있습니다. 그러면 신규로 등록된 공제 항목으로 부가세 신고 시 적용됩니다.

이 때 확인하셔야 할 점은 해당 농수산물이 사업에 직접 사용되었는지, 그리고 처음부터 신용카드 매입세액에 포함이 되어야 할 건이었는데 잘못 선택되었던 것인지 판단하셔야 합니다.

의제매입세액 공제 항목인 농수산물 구매가 불공제로 처리된 경우, 별도의 의제매입세액공제 신고를 하지 않으면 공제 대상에서 제외될 수 있습니다. 불공제에서 공제로 변경하시면 그만큼 세액공제를 받을 수 있게 됩니다.

참고로, 사업자가 부가세를 신고할 때 법에 따라 세무서에 제출해야 하는 부가가치세 과세표준 신고서 등에는 사업자가 부가세 과세표준을 계산하여 작성하고 제출해야 하기 때문에 추후 세무조사시 문제될 수 있으니 주의하셔야 합니다.

결론적으로, 사업용 신용카드 이용 내역 중 선택불공제에서 불공제로 처리된 내역 중 의제매입세액공제가 가능한 내역이 있으시면 부가세 신고 시 공제로 변경하여 신고하시는 것이 좋습니다.