세무 Q&A
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Q.
12/31 퇴사자 연말정산 관련문의
안녕하세요.
12/31일자 중도퇴사자(2025년 퇴사)의 연말정산 처리 방법에 대해 문의드립니다.
해당 직원에 대해 아래 두 가지 방법 중 어떤 처리가 세무적으로 적절한지 고민 중입니다.
1.
2025년 12월 31일 퇴사자를
2026년 2월 귀속 · 2월 지급분 연말정산 원천세 신고서에
연말정산 대상자로 입력하여 처리하는 것이 가능한지요?
→ 즉, 2025년도 퇴사자를 2026년 2월 귀속 연말정산으로 신고하는 것이 세무적으로 맞는 처리인지 궁금합니다.
2.
2026년 1월에
연말정산 간소화 자료 조회
공제신고서 작성
최종 정산세액 확정 후
이를 연말정산으로 신고하지 않고,
해당 공제금액을 중도퇴사자 소득세 정산에 반영하여
중도퇴사자 소득세로 신고해도 가능한지요?
(※ 12월 급여를 1월에 지급하고, 원천세는 2월에 신고 예정이라 신고 시기상 문제는 없는 상황입니다.)
세무적으로 적정한 처리 방법에 대해 조언 부탁드립니다. 감사합니다.
김*경 님
조회 : 2848건
답변 : 4건
25.12.31
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이시열 세무사 답변 채팅ㆍ전화상담 추가요청
25.12.31
채택답변
안녕하세요,
안강세무회계 이시열세무사입니다.
1. 원칙적으로 12월 31일 근무자는 연말정산대상자로 봐야 합니다.
2. 중도퇴사자 정산으로 하더라도 결과가 같기에 문제 없습니다
감사합니다
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강태훈 세무사 답변 채팅ㆍ전화상담 추가요청
25.12.31
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김경록 세무사 답변 채팅ㆍ전화상담 추가요청
25.12.31
2025년 12월 31일 퇴사자의 연말정산 처리에 대해 실무적으로 가장 적절한 방법을 안내해 드립니다.
결론부터 말씀드리면, **2번 방법(1월에 자료를 받아 중도퇴사 정산에 반영)이 실무적으로 더 권장되며 깔끔한 처리 방식**입니다. 각 항목에 대한 세무적 판단 근거는 다음과 같습니다.
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### 1. [방법 1]에 대한 판단 (2월 연말정산 포함 여부)
**결론: 원칙적으로는 가능하나, 실무상 번거로움이 큽니다.**
* **세무적 근거:** 12월 31일 퇴사자는 해당 연도 전체를 근무한 사람입니다. 따라서 다음 해 2월에 실시하는 '계속근로자 연말정산' 대상에 포함하여 신고해도 법적인 문제는 없습니다.
* **단점:** 퇴사자는 이미 회사 시스템(ERP나 그룹웨어) 접속 권한이 상실된 경우가 많아, 2월까지 연락을 유지하며 자료를 보완하거나 서명을 받는 과정이 매끄럽지 않을 수 있습니다. 또한, 퇴사 시점에 이미 중도퇴사 정산을 끝내야 하는데, 이를 2월까지 미뤄두는 것은 관리상 부담이 됩니다.
### 2. [방법 2]에 대한 판단 (1월 중도퇴사 정산 반영) - **추천**
**결론: 가장 적절하고 실무적인 방법입니다.**
귀사의 상황처럼 **12월 급여를 1월에 지급**하고 **2월에 원천세 신고**를 하는 일정이라면, 1월 중순에 열리는 '연말정산 간소화 서비스' 자료를 충분히 활용할 수 있습니다.
* **처리 절차:**
1. 1월 15일 이후, 퇴사자에게 **간소화 자료(PDF)**와 **공제신고서**를 제출받습니다.
2. 이를 12월분 급여 정산(중도퇴사 정산) 시 반영합니다.
3. 최종 확정된 세액을 포함하여 **2월 10일까지 원천세 신고**를 완료합니다.
4. 퇴사자에게는 모든 공제가 반영된 **지급명세서**를 교부합니다.
* **장점:** 퇴사자 입장에서도 5월에 별도로 종합소득세 신고를 할 번거로움이 사라지고, 회사 입장에서도 2월 계속근로자 정산 명단에서 퇴사자를 분리하여 관리할 수 있어 효율적입니다.
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### 3. 세무 처리 시 주의사항 (체크리스트)
* **중도퇴사 정산의 성격:** 사실 '중도퇴사 정산'과 '연말정산'은 계산 방식이 동일합니다. 다만 퇴사 시점에 자료가 없어서 기본공제만 적용하느냐, 자료를 받아서 특별공제까지 적용하느냐의 차이일 뿐입니다.
* **지급명세서 제출 기한:** 12월 31일 퇴사자라면 **2026년 3월 10일**까지 근로소득 지급명세서를 제출해야 합니다. 1월에 정산을 완료했다면 이때 한꺼번에 제출하시면 됩니다.
* **퇴직금 관련:** 정산 결과 결정세액이 줄어들어 환급액이 발생한다면, 이를 12월 급여(또는 퇴직금) 지급 시 합산하여 지급하시면 됩니다.
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### **요약 추천**
**2번 방법**으로 진행하시길 권장합니다.
1월 중순 간소화 서비스 오픈 직후 퇴사자에게 자료를 요청하여, **1월 지급되는 12월분 급여 상에서 정산을 마무리**하고 2월 10일에 원천세 신고를 하는 것이 가장 정확하고 깔끔한 업무 처리입니다.
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한동진 세무사 답변 채팅ㆍ전화상담 추가요청
25.12.31
말씀하신 1번 방법(연말정산 대상자 포함)으로 진행하시는 것을 권장해 드립니다.
원칙적인 처리: 12월 31일 퇴사자는 해당 연도를 가득 채워 근무했으므로 사실상 '계속근로자'에 해당합니다.
또한 1월에 열리는 간소화 서비스 자료를 온전히 반영할 수 있습니다. 이를 통해 근로자가 5월에 별도로 종합소득세를 신고해야 하는 번거로움을 덜어줄 수 있다는 큰 장점이 있습니다.
퇴사하시는 분께 "간소화 자료를 통해 혜택을 온전히 받으실 수 있도록 정식 연말정산으로 진행해 드리겠다"고 잘 설명해 주시고 절차를 밟으시면 될 것 같습니다.
찾아줘 AI
참조만 부탁드립니다.
결론 요약
- 12/31 퇴사자는 “퇴직 시점 정산(중도퇴사자 정산)”으로 처리하는 것이 원칙이며, 이에 따라 2026년 2월 신고(1월 지급분 포함) 시 중도퇴사자 정산분으로 반영하는 것이 적정합니다.
- 즉, 질문의 2번 방식이 세법상 맞는 처리이고, 1번처럼 재직자 연말정산(2월 일괄) 대상자로 올려 신고하는 방식은 원칙에 맞지 않습니다.
근거와 이유
- 소득세법 체계상, 근로자가 해당 연도 중 퇴직한 경우 원천징수의무자는 “퇴직하는 때(퇴직월 급여 지급 시)”에 연말정산을 해야 합니다. 12/31 퇴사도 ‘중도퇴사자’에 해당하며, 최종 급여를 1월에 지급하더라도 그때 퇴직정산을 하여 2월에 원천세 신고·납부합니다.
- 2월 귀속 연말정산은 통상 “재직자”에 대한 연말 일괄정산을 말하므로, 이미 퇴사한 인원을 재직자와 함께 연말정산 대상자로 포함하는 것은 원칙에 부합하지 않습니다. 실무상 홈택스/프로그램에서도 퇴직자 정산은 ‘중도퇴사자 정산’으로 구분 처리합니다.
실무 처리 가이드(권장 프로세스: 질문 2번)
1) 2026년 1월 중
- 연말정산 간소화 자료 수집(1/15 이후 가능), 공제신고서 접수
- 공제 항목(기본·추가·인적·보험료·의료비·교육비·신용카드·월세 등) 최종 반영
2) 2026년 1월 급여 지급 시
- 2025년 귀속분 전체를 기준으로 퇴직정산(중도퇴사자 정산) 수행
- 기납부세액과의 차이를 급여에서 정산(추가징수/환급)
3) 2026년 2월 원천세 신고
- 1월 지급분 신고 시 ‘중도퇴사자 정산분’으로 반영하여 신고·납부
4) 2026년 3월 10일까지
- 근로소득 지급명세서 제출(퇴사일 기재), 근로소득원천징수영수증 교부
유의사항
- 12월 급여를 1월에 지급하더라도 귀속연도는 2025년입니다. 2025년 한도·공제요건을 적용하세요.
- 간소화 자료가 늦게 반영되는 항목(의료비 수정, 월세 등)이 있으면 정정신고로 보완하거나, 근로자가 2026년 5월 종합소득세 신고로 추가 공제를 받을 수 있습니다.
- 동일 인원을 회사의 ‘재직자 연말정산’에 다시 포함(이중 정산)하지 않도록 주의하세요.
요약하면, 질문 2번 방식(퇴직정산으로 반영 후 2월 신고)이 세무적으로 적정하고 실무에도 부합합니다.
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