중도퇴사자 연말정산 및 원천세 신고 누락

안심하셔도 됩니다. 지금 연말정산으로 정리하시면 되고, 기한 내 처리하면 근로자 불이익도 없습니다.

핵심 정리
- 지금 해도 됨: 중도퇴사자 연말정산을 당시에 못 했더라도, 다음해 정기 연말정산(’25 귀속분은 ’26.3.10까지)으로 함께 처리 가능합니다.
- 기한: 2026.3.10까지 원천세(연말정산분) 신고·납부 및 근로소득 지급명세서 제출을 완료하세요. 이 기한을 넘기면 기한후 신고로 가산세가 붙습니다.
- 대상 구분:
- 11월 말 퇴사한 2명: 귀사에서 ’25년 연말정산 처리 대상(단, 퇴사 후 같은 해에 타회사 재취업했다면 귀사는 정산하지 않고 원천징수영수증만 발급).
- 12월 19일 퇴사 2명: 일반 연말정산 처리 대상(동일).

권장 처리 순서
1) 대상자 확인
- 11~12월 퇴사자 4명 모두 ’25년에 다른 회사로 이직했는지 여부 확인.
- 이직한 경우: 귀사는 연말정산 제외, 즉시 원천징수영수증 발급(전자교부 가능). 이직 안 했다면 귀사에서 정산.

2) 자료 수집(퇴사자 포함)
- 소득·세액공제신고서, 부양가족(인적공제) 신고서.
- 간소화자료(보험료·의료비·교육비·기부금·주택자금·월세 등). 국세청 간소화자료를 직원이 PDF로 제공하거나 자료제공 동의로 수집.
- 미제출 시 기본공제 등 제출된 범위 내로만 정산 가능(추후 근로자가 5월 종소세로 추가 공제 가능).

3) 연말정산 계산
- ’25년 총급여·비과세·4대보험·기제출 공제자료 반영하여 개인별 정산세액 산출.
- 퇴사자도 동일한 방식으로 계산합니다(근무월수는 비과세 한도 산정 등에만 영향).

4) 정산금 정리(추가징수/환급)
- 환급: 회사가 근로자에게 송금(퇴사자는 계좌 확인 필수) 후, 2월분 원천세 신고 시 환급세액과 상계 청구.
- 추가징수: 근로자에게 회수 요청하되, 회수가 어려워도 회사는 신고·납부기한 내 납부 의무가 있습니다.

5) 신고·제출
- 국세: 2026.3.10까지 2월분 원천세 신고(연말정산분 포함) 및 납부.
- 지방소득세(특별징수분): 동일 기한 내 신고·납부.
- 근로소득 지급명세서(원천징수영수증 전산제출): 2026.3.10까지 국세청 제출.
- 근로자 교부: 원천징수영수증을 퇴사자 포함 전원에게 교부(전자 교부 권장).

6) 기한을 넘긴 경우
- 가능한 빨리 기한후 신고·납부하세요. 신고불성실/납부불성실 가산세가 발생할 수 있습니다. 지급명세서 지연·미제출도 과태료 대상입니다.

자주 묻는 점/주의사항
- “연말정산 후 → 원천세 신고(기한후) → 환급” 순서?”: 기한 내(3/10) 신고가 원칙입니다. 환급은 보통 회사가 근로자에게 먼저 지급하고, 2월분 원천세 신고 시 상계 또는 환급을 신청합니다. 기한 내 처리하면 ‘기한후’가 아닙니다.
- 퇴사자가 자료를 안 주는 경우: 제출분만 반영해 정산하고, 근로자가 5월 종합소득세 신고로 추가 공제를 받을 수 있게 원천징수영수증을 제때 교부하세요.
- 간이지급명세서: 상시근로자도 반기별 간이지급명세서 제출 대상일 수 있습니다. 2025년 하반기분 기한(통상 1/31)도 확인하세요. 미제출·지연 시 과태료가 있습니다.

지금 당장 하실 일 체크리스트
- 퇴사자 4명의 ’25년 내 재취업 여부 확인
- 퇴사자에게 공제자료 요청(제출기한 명확히 안내, 계좌 확인)
- 연말정산 계산 및 개인별 정산내역 통지
- 환급 송금/추가징수 회수 시도 증빙 확보
- 2026.3.10까지
- 2월분 원천세(연말정산분) 신고·납부
- 지방소득세 특별징수 신고·납부
- 근로소득 지급명세서 제출
- 원천징수영수증 교부

필요하시면 직원별로 어떤 서류가 필요한지, 신고서 입력 항목(연말정산분 칸)과 환급 상계 처리 방법도 정리해 드리겠습니다.