원천세 반기납부 신청 2026년 12월|상시고용인원 20명 이하·12월 1일~31일 신청

학원 세무 실무의 모든 것 완벽 정리
안녕하세요 세무회계 선재입니다.
학원을 운영하시는 원장님들이라면 주목해 주세요!
학원도 부가가치세 신고를 해야되는건지
강사료는 3.3%로 지급해도 되는지
학부모 상담에 활용할 수 있는 교육비 세액공제 최신 개정안까지
성공적인 학원 운영을 위한 세무 가이드를 알기 쉽게 설명해 드리겠습니다.
개인사업자라면 매년 1월과 7월에 다가오는 부가가치세 신고, 과연 우리 학원도 해당할까요?
결론부터 말씀드리면, 주무관청의 인허가 여부에 따라 과세와 면세로 나뉩니다.
1. 부가가치세가 '면제'되는 학원(면세사업자)
학생들을 가르치는 대부분의 일반적인 학원은 교육청이나 지자체 등 주무관청의 인허가(또는 등록/신고)가 필수입니다.
이렇게 주무관청의 인허가를 받고 교육 용역을 제공하는 학원은 부가가치세가 면제되는 면세사업자에 해당합니다.
(다만 무도학원(댄스학원)과 자동차운전학원은 예외로 부가가치세가 과세되는 학원입니다^^)
2. 부가가치세가 '과세'되는 학원(과세사업자)
반대로 주무관청의 인허가를 받지 않고 운영할 수 있는 성인 대상의 자격증 취득 또는 취미 목적인 실용음악학원, 어학원, 간호조무학원 등은 부가가치세가 과세되는 과세사업자에 해당하는 것입니다.
부가가치세법 제26조 [ 재화 또는 용역의 공급에 대한 면세 ] ① 다음 각 호의 재화 또는 용역의 공급에 대하여는 부가가치세를 면제한다.(2013.06.07 개정) 6. 교육 용역으로서 대통령령으로 정하는 것(2013.06.07 개정) 부가가치세법시행령 제36조 [면세하는 교육 용역의 범위] ① 법 제26조 제1항 제6호에 따른 교육 용역은 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 시설 등에서 학생, 수강생, 훈련생, 교습생 또는 청강생에게 지식, 기술 등을 가르치는 것으로 한다.(2013.06.28 개정) 1. 주무관청의 허가 또는 인가를 받거나 주무관청에 등록되거나 신고된 학교, 어린이집(「영유아보육법」 제10조에 따른 어린이집을 말하며, 같은 법 제24조 제2항 및 제3항에 따라 국공립어린이집이나 직장어린이집 운영을 위탁받은 자가 제공하는 경우를 포함한다), 학원, 강습소, 훈련원, 교습소 또는 그 밖의 비영리단체(2024.02.29 개정) ② 제1항에도 불구하고 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 학원에서 가르치는 것은 법 제26조 제1항 제6호에 따른 교육 용역에서 제외한다.(2013.06.28 개정) 1. 「체육시설의 설치ㆍ이용에 관한 법률」 제10조 제1항 제2호의 무도학원(2013.06.28 개정) 2. 「도로교통법」 제2조 제32호의 자동차운전학원(2013.06.28 개정) |
과세사업자 학원은 매년 1월과 7월(법인은 분기별) 부가가치세 신고를 하기 때문에 국세청에서 학원의 수입금액을 자연스럽게 파악할 수 있습니다.
하지만 면세사업자는 부가가치세 신고 의무가 없기 때문에 국세청 입장에서는 이 학원이 1년 동안 얼마를 벌었는지 파악이 어렵습니다.
그래서 5월 종합소득세 신고 전에 미리 학원의 1년간 총 수입금액과 주요 경비를 파악하기 위한 절차가 바로 '사업장현황신고'입니다.
① 제출 기한 및 서류
매년 2월 10일까지 사업장 현황신고서에 아래 서류를 첨부하여 제출해야 합니다.
• 매입처별 세금계산서 합계표
• 매출 • 매입처별 계산서 합계표
• 학원사업자 수입금액검토표
※ 학원사업자 수입금액검토표란?
학원사업자의 기본사항(상호,사업자등록번호,주민번호등)부터 직원현황, 교습현황, 총수입금액, 주요경비의 사용금액을 작성하는 서식.
② 미제출 시 제재사항
학원 사업자가 사업장현황신고를 이행하지 않거나 수입금액을 과소신고 했다고 가산세가 부과되지는 않습니다(의료업 등 특정업종만 부과)
단! 함께 제출해야 하는 매출•매입처별 (세금)계산서 합계표를 제출기한 내 미제출하거나 사실과 다르게 기재되는 등의 경우에는,
공급가액의 0.5% 만큼 가산세가 부과됩니다. 따라서 합계표 제출 꼼꼼하게 챙기셔야 합니다.
사업장 현황신고를 통해 1년간의 학원 총매출과 경비를 정리해 보면,
다가오는 5월에 납부할 예상 종합소득세를 산출해 볼 수 있습니다.
세금 납부를 위한 자금을 여유있게 준비할 수 있는 좋은 기회로 활용해 보시기 바랍니다.
아마 학원 원장님들이시라면 가장 공감하실 것 같은데요.
실제로 원장님들께서 가장 고민하고 많이 질의하시는 건 인건비, 노무 관련입니다.
① 인건비 소득구분
인건비 신고 유형은 크게 세 가지(일용 vs 상용 vs 인적용역 사업자)로 나눌 수 있습니다.

| 질문 | 답변 | 결과 | 제출 서류 |
|---|---|---|---|
| 고용관계 없이 독립된 개인으로부터 용역을 제공받나요? | 예 | 인적용역사업자 | 간이지급명세서 (거주자의 사업소득) |
| 고용관계 없이 독립된 개인으로부터 용역을 제공받나요? | 아니요 | 다음 질문으로 이동 | |
| 임금을 일급 또는 시급으로 계산하여 지급하나요? | 아니요 | 상용근로자 | 간이지급명세서 (근로소득) |
| 임금을 일급 또는 시급으로 계산하여 지급하나요? | 예 | 다음 질문으로 이동 | |
| 실제 고용기간이 3개월 (건설공사 종사자 1년) 미만인가요? | 아니요 | 상용근로자 | 간이지급명세서 (근로소득) |
| 실제 고용기간이 3개월 (건설공사 종사자 1년) 미만인가요? | 예 | 일용근로자 | 일용근로소득 지급명세서 |
보통 시험기간이나 바쁜 주말시간에만 도와주시는 조교 선생님들은 일용직 근로자에 해당합니다.
원장님들께서 주목할 것은 상용근로자(정규직) vs 인적용역 사업자(프리랜서) 의 구분입니다.
이 둘은 세금 신고 방식 뿐만 아니라 4대보험, 퇴직금 등 노무 이슈와도 직결되기 때문입니다.
② 정규직 vs 프리랜서 구분 기준

| 기준 | 정규직 | 프리랜서 |
|---|---|---|
| 계약 형태 | 근로계약서 | 위촉 계약 / 용역 계약 |
| 출퇴근 시간 및 장소 | 학원에서 정해준 고정된 시간과 장소 | 출퇴근 시간이 자유로움 |
| 업무 지시 및 감독 | 원장님의 구체적인 지휘 감독을 받음 | 독립적으로 자신의 책임하에 강의 |
| 급여 지급 방식 | 고정 급여 | 강의시간, 수강생 수 등에 비례한 비율/수당제 |
| 세금 신고 방식 | 근로소득세(by 근로소득 간이세액표) 원천세 신고 납부 (~다음 달 10일) + 근로소득 간이지급명세서 제출 (~1월 말, ~7월 말) + 근로소득 지급명세서 제출(~다음 해 3월 10일) | 사업소득세(by 총 지급액의 3.3%*) 원천세 신고 납부 (~다음 달 10일) + 사업소득 간이지급명세서 제출 (~다음 달 말) + 사업소득 지급명세서 제출(~다음 해 3월 10일) |
| 퇴직금 | 1년 이상 주 15시간 이상 근무 시 지급 | 원칙적으로 지급 의무 없음 |
* 27.01.01 지급분부터 인적용역 사업자의 원천징수세율 2.2%로 개정안 발표(26년 12월 확정예정)
위 표 내용상 정규직으로 구분해야 함에도 불구하고 프리랜서로 인건비 신고를 하면 안 되는건지 궁금하실 것 같습니다.
서울지방고용노동청서울강남지청 학원강사등의 근로자성 구분 준수 공문

호호훈훈 호국보훈, 그분들이 지켜준 미소, 우리들이 전하는 감사
고용노동부

4. 따라서, 반드시 근로기준법상 근로자의 근로계약과 그 외 계약을 명확히 구분해서 운영하는 것이 추후 당사자간 법적 분쟁을 예방하는 방법입니다.
5. 또한, 우리부에서는 최근 임금체불 사업장에 대하여 전수조사 · 감독을 실시하고 있음을 알려드니 노동법 등 법적 분쟁이 발생할 수 있는 계약관계를 면밀히 살피는 등 노무관리에 만전을 기하시기 바랍니다. 끝.
국세청 소득종류 구분 협조 안내문

안녕하십니까? 항상 국세행정에 협조하여 주셔서 감사드립니다.
국세청은 모든 근로자가 고용보험 혜택을 받을 수 있도록 사업자로부터 근로자 등의 지급명세서를 매월 수집하여 근로복지공단에 제공하고 있습니다.
사업주는 지급명세서를 제출할 때, 사업장에서 일하는 분이 근로자에 해당하는지 사업소득자(프리랜서)에 해당하는지 정확히 구분하고, 소득 유형에 맞는 지급명세서를 제출하여야 합니다.
귀사가 제출한 '24년 간이지급명세서를 검토한 결과 인적용역 사업소득자(프리랜서)를 신고한 내역이 확인됩니다.
뒷면을 참조하여 근로자를 사업소득자(프리랜서)로 분류한 것은 아닌지 다시 한번 확인해주시기 바라며, 앞으로도 소득 유형에 맞는 지급명세서 제출을 당부드립니다.
위 사진들은 실제로 학원을 운영하시는 원장님께서 국세청으로부터 받으신 안내문입니다.
내용의 핵심은 정규직(근로소득)으로 신고해야 할 강사님을 프리랜서(3.3% 사업소득)로 잘못 신고한 것은 아닌지 확인해 달라는 것입니다.
종종 4대보험료 납부를 피하기 위해(국민연금, 건강보험, 고용보험은 원장님과 강사님이 절반씩 부담), 실제로는 정규직으로 일하는 강사님을 3.3% 프리랜서로 신고하는 경우들이 있습니다.
하지만 이는 이는 정말 위험한 것인데요!
세법과 노무는 '형식'보다 '실질'을 중시하기 때문에 3.3% 프리랜서로 신고했더라도, 실제 출퇴근 시간이 정해져 있고 원장님의 지시를 받으며 일했다면 '근로자'로 인정됩니다.
그렇게 되면 수년간 밀린 퇴직금을 한 번에 지급하거나 미납했던 4대보험료와 과태료를 한 번에 납부해야 할 수도 있습니다.
③ 그래서 어떻게 해야 하는 걸까요?
결론부터 말씀드리면, 국세청과 노동청의 기준은 확고합니다. 일하는 방식에 맞게 실질로 신고하라는 것입니다.
1. 근로소득으로 신고해야 하는 경우
강사님이 원장님의 구체적인 지휘·감독을 받거나, 출퇴근 시간이 정해져 있고(종속성), 우리 학원에서만 일하며(전속성), 고정된 기본급을 받는다면 어떨까요?
대법원 판례(2017.01.25. 선고 2015다59146 판결 등)에 따라 '근로자성'이 명백히 인정되므로, 반드시 4대보험에 가입하고 근로소득세로 원천세 신고를 진행해야 합니다.
2. 3.3% 사업소득(프리랜서)으로 신고해도 되는 경우
하지만 실제 학원업 특성상 '프리랜서' 형태로 활동하시는 강사님들도 많습니다.
- 우리 학원뿐만 아니라 다른 학원에도 출강하시는 분
- 방학 시즌 등에만 특강을 해주시는 분
- 본인만의 교재 연구실이나 개인 직원을 따로 두시는 분
- 상호 동등한 관계로 위수탁 계약을 체결한 경우로서 비율/수당제로 보수를 받는 경우
이처럼 원장님의 학원에 종속되지 않고 독립적인 자격으로 강의를 해주시는 강사님이라면, 사실관계에 부합하게 3.3% 사업소득으로 신고하시면 됩니다.
!필독!
세무와 노무는 언제나 실질이 우선이지만, 혹시 모를 분쟁을 예방하려면 '형식(계약서)'도 갖춰두는 것이 정말 중요합니다.
프리랜서 강사님과 계약할 때는 일반적인 '근로계약서'가 아닌 '위촉(또는 용역)계약서' 를 작성하시면 되고,
본 계약은 독립적인 사업자 간의 계약이며, 강사는 학원에 종속되어 지휘·감독을 받지 않는다 는내용을 기재해둔다면 입증에 도움이 되실 겁니다
(실무에서 근로자성 판단이 모호한 분들도 계실텐데요. 그분들은 세무사와 노무사 등의 자문을 받아서 위촉계약서를 작성해야합니다).
결론은 계약 형태, 출퇴근 방식, 급여지급 방식, 업무 지시감독 여부 등 실질에 맞춰
정규직은 근로소득으로, 프리랜서는 3.3% 사업소득으로 명확하게 구분하여 신고하는 것이
원장님의 소중한 자산을 지킬 수 있는 방법입니다.
이제 학원 원장님들을 위한 절세 팁 전수드립니다!
① 누락없는 인건비 신고(가족 인건비 활용법)
강사료뿐만 아니라 채점 아르바이트, 조교님, 셔틀 기사님 인건비 등 학원 운영에 들어간 모든 인건비는 원천세 신고를 통해 전액 비용으로 인정받아야 합니다.
원천세를 신고하지 않고 지급명세서 제출 없이 인건비를 비용처리 하게 되면 가산세가 부과됩니다.
가족 인건비 활용법
특히 실제로 가족분들께서 학원 일을 도와주시는 경우가 꽤 많은데요!
배우자나 자녀분께서 학원 행정, 원생 상담, 수납 업무 등을 실제로 돕고 있다면 금융계좌로 급여를 지급하고 원천세 신고를 하셔야합니다.
그래야 원장님께 집중된 소득을 가족분들에게 분산시켜 종합소득세율을 낮출 수 있는 쏠쏠한 절세수단이 된답니다!
② 놓치기 쉬운 학원 경비 적격증빙 챙기기
소액이라도 꼭 적격증빙(세금계산서, 계산서, 신용카드 매출전표, 현금영수증)이 있어야 경비 인정이 되니 잘 수령해 두시기 바랍니다.
특히 사업용 신용카드를 홈택스에 등록해 두시면 카드사로에 별도로 자료요청 할 필요가 없어 간편하니 미리 등록해 두시기 바랍니다.

| 구분 | 비용 항목 예시 |
|---|---|
| 시설 및 인테리어 | 가벽 or 칸막이 공사, 냉난방기 공사, 방음도어, 전기 조명공사 (일시 비용처리x 매년 일정액씩 비용처리o) |
| 고정비 렌탈비 | 정수기, 공기청정기, 복합기 렌탈료 등 |
| 업무추진비(접대비) | 학부모, 거래처, 강사 경조사비 (현재 건당 최대 20만원 26년 세법 개정안은 30만원) |
| 운영 및 소모품비 | 교재 인쇄비, 출력비, 복사용지, 문구류 |
| 차량 유지비 | 원생 통학용 셔틀차량(9인승 이상) 유류비, 보험료, 수리비, 자동차세, 감가상각비 |
| 이자비용 | 임차 보증금이나 초기 시설자금을 위한 사업용 대출 이자비용 |
③ 우리 학원은 세액감면이 될까?
사업자라면 놓치면 안 될 대표적인 세액감면은 아래 세가지가 있는데요! 학원 별로 적용가능한지 살펴보면 다음 표와 같습니다.

아쉽게도 입시·교과 중심의 일반 학원은 세법상 감면 대상에서 제외되지만, 취업·자격증 중심의 직업기술 분야 학원은 3가지 혜택을 모두 적용받을 수 있습니다.
🪄 학원은 '현금영수증 의무발행 업종'입니다

위 두 가지만 기억하세요!
거래 건당 10만원 이상 거래할 경우 무조건 현금영수증은 발행하셔야 합니다.
학부모님께서 발행 요청 하지 않으시거나 거절하시더라도 마법의 번호 010-000-1234로 반드시 발행하시기 바랍니다.
특히 학원업은 현금영수증 미발행 제보가 적지 않은 편이니 각별한 주의가 필요합니다.
🥕 만 9세 미만(초등 1~2학년) 예체능 학원비 교육비 세액공제(15%) 가능
기존에는 미취학 아동의 학원비만 연말정산 교육비 세액공제 대상이었으나,
2026년 1월 1일 지출분부터 만 9세 미만(초등 1~2학년) 자녀의 예체능 학원비가 교육비 세액공제 대상에 새롭게 포함되었습니다.

원장님 활용 팁
2026년 귀속 종합소득세 신고 기간인 27년도 5~6월에
초등 1~2학년 학부모님들의 교육비 납입증명서 및 현금영수증 발급 요청이 크게 늘어날 것으로 보입니다.
예체능 학원 원장님이시라면 신규 원생 등록 및 학부모 상담 시
"초등학교 2학년(만 9세 미만)까지 연말정산 교육비 세액공제 혜택을 받으실 수 있습니다"*라는 점을
적극적으로 안내하셔서 마케팅 포인트로 활용해 보세요!

초등학교 저학년 자녀 예체능 학원비 세액공제 15%
| 구분 | 주요대상 | 한도 |
|---|---|---|
| 본인 | • 대학원비 • 직업능력개발훈련을 위한 수강료 | 한도 없음 |
| 장애인 | • 장애인재활교육을 위한 특수교육비 | |
| 취학전 아동 | • 유치원·어린이집 수업료 • 학원 및 체육시설업자에게 지급한 교육비 | 300만원 |
| 초중고생 대학생 | • 수업료·입학금 등 공납금 • 방과후학교 수업료 및 교재비(초중고생) • 급식비·교과서대금(초중고생) • 교복구입비(중고생, 한도 50만원) • 예체능 학원비(만 9세 미만) | 초중고생 300만원 대학생 900만원 |
2026년 1월 1일 이후 지출하는 분부터 적용
!!주목!!
학원비의 교육비 세액공제 변경 연혁을 정리해보면 다음과 같습니다.

올해까지는 미취학 아동은 예체능 외 학원비도 교육비 세액공제가 적용이 가능하지만
세법개정안이 확정 된다면 미취학아동과 초등 1,2학년 모두 동일하게
학원비는 '예체능 학원비'만 교육비 세액공제가 가능할 것으로 보입니다.
따라서 27년도부터는 미취학 아동의 일반 과목 학원비는 공제가 어려울 수 있으니
세법 개정 추이를 지켜보시기 바랍니다.

(소득법 §59의4③, 소득령 §118의6①)
| 현 행 | 개 정 안 |
|---|---|
| □ 교육비 세액공제 ㅇ (공제율) 본인 또는 부양가족 교육비 지출액의 15% 세액공제 ㅇ (공제대상) - (본인) 대학(원) 학비, 직업능력개발훈련비 등 - (초중고·대학생) 수업료, 교재비, 입학금, 일반대학의 대학입학전형료, 수능응시료, 예능학원·체육시설 교육비* 등 * 과세기간 종료일 현재 9세 미만 또는 2학년 이하 초등학생 한정 - (취학전 아동) 유치원·어린이집 수업료, 학원비, 체육시설 교육비 등 | □ 공제대상 합리화 ㅇ (좌 동) - 특별법에 따른 대학의 입학전형료 추가 - 학원비 → 예능학원* 교육비 * 예능(음악·미술·무용)을 교습과정으로 하는 학원 |
학원업은 교육청 인허가에 따른 면세 여부 확인부터 매년 2월 사업장현황신고, 강사 인건비 구분, 그리고 현금영수증 의무발행까지
일반 업종과는 세무 체크포인트가 많습니다.
바쁜 수업과 학원 운영으로 세무 관리가 막막하시다면 혼자 고민하지 마시고 학원업 전문 세무사의 도움을 받아보시길 권장합니다.
전국의 모든 원장님들의 성공적인 학원 운영을 응원합니다!