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연말정산은 원칙적으로 근로소득에 대해서만 진행되는 것으로, 근로 외 기타소득, 사업소득 등은 별도로 종합소득세 신고를 통해 처리해야 합니다. 따라서, 회사에서는 본인의 근로소득만을 기준으로 연말정산을 진행하게 됩니다.

자녀, 부모 등에 대한 부양가족 인적공제의 경우는 근로소득세에서 공제받을 수 있으므로 소득이 더 높은 자를 기준으로 신청하는 것이 유리합니다. 따라서 본인이 부양가족 인적공제를 요청하는 것이 납부세액을 줄이는 데 도움이 될 것입니다.

다만, 위의 상황에서 본인이 근로소득에 대한 연말정산을 진행하고, 종합소득세 신고를 통해 기타소득에 대한 세액을 납부해야 하며, 이 때 본인이 부양가족 인적공제를 전액 사용한 경우 기타소득에 대한 공제는 받을 수 없게 됩니다.

결론적으로, 현 상황에서는 본인이 부양가족 인적공제를 받고 근로소득과 기타소득에 대한 세액을 각각 납부하는 것이 가장 효율적일 것으로 보입니다. 그러나 세법은 복잡하고 변동이 잦으므로, 구체적인 상황에 따라 다를 수 있으니 전문가의 도움을 받아 세무 계획을 세우시는 것이 좋습니다.