1. 아마도 그렇게 추측이 되는군요. 만약 회사와 연금사업자 모두 원천징수를 했다면 이중으로 신고가 된 것이 맞습니다. 하지만 이는 정확한 확인을 위해서는 회사의 재무나 개인과연금 담당부서와 상의해야합니다.

2. 원천세 수정신고에 대한 가산세는 일반적으로 원천세 대납액의 20%) 가산세가 부과됩니다. 그러나 퇴직소득에서 DC(퇴직연금)을 제외한 금액을 원천세 신고하였는데, 실제로는 DC를 포함한 금액을 원천세 신고해야 하는 경우에는 수정신고를 하더라도 가산세가 부과되지 않습니다. 실제로 DC금액에 대한 원천세는 연금시행기관이 징수하므로, 대체로 조정이 필요하다면 연금시행기관을 통해 해결합니다.

3. 퇴직소득 지급명세서 수정을 안 할 경우에는 과납세를 하는 상황이 발생할 수 있습니다. 즉, 실제로 납부해야 할 세액보다 많은 세금을 납부하게 되는 것입니다. 또한 제출서류의 내용이 실제 상황과 다르다면 이후에 세무조사 등에서 문제가 생길 수도 있습니다.

정확한 상황 판단을 위해서는 회사 재무나 개인과연금 담당부서와 상의하거나 세무사에게 문의를 해보시는 것이 좋습니다.