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결론부터 말씀드리면, 부가세는 “신고 시점의 업종 코드”가 아니라 “해당 과세기간에 실제로 발생한 매출의 업종”을 기준으로 계산합니다. 즉, 업종 변경일(2025-12-30)과 무관하게 2025년 2기(7~12월) 매출이 어떤 업종에서 발생했는지에 따라 업종별 부가가치율을 적용합니다.

구체적으로
- 2025년 2기 동안 전자상거래(525101) 매출만 있었다면: 전부 15% 업종별 부가가치율로 신고
- 2025년 2기에 소프트웨어 개발·공급(722000) 매출도 있었다면: 업종별로 매출을 구분해
- 전자상거래 매출에는 15%
- 소프트웨어 개발·공급 매출에는 30%
를 각각 적용해 합산 신고
- 만약 업종별 매출 구분이 현실적으로 어려우면: 주된 업종(매출이 큰 업종)의 부가가치율로 일괄 적용할 수 있으나, 가능하면 업종별로 구분·입력하는 것이 안전합니다.

신고 방법 팁
- 홈택스 간이과세 신고서에서 업종을 복수로 추가하고, 업종별 공급대가(매출)를 각각 입력하면 시스템이 업종별 부가가치율을 자동 적용해 합산합니다.
- 2026년 1기(1~6월)부터 소프트웨어 매출만 발생한다면, 그때는 722000(30%)만 적용하시면 됩니다.

근거(요지)
- 간이과세자는 업종별 부가가치율을 적용해 납부세액을 계산하며, 둘 이상의 업종을 겸영하는 경우 업종별 매출에 해당 업종의 부가가치율을 각각 적용해 합산합니다(부가가치세법 제63조, 시행령 제109조 취지).

요약: 2025년 2기 매출이 대부분 전자상거래라면 15%로 신고하시되, 해당 기간 중 소프트웨어 매출이 있었다면 그 부분에만 30%를 적용해 분리 신고하면 됩니다.