부가가치세법에서는 재화 또는 용역의 공급과 "직접 관련되지 아니하는" 국고보조금과 공공보조금은 공급가액에 포함하지 아니한다라고 규정을 하고 있습니다.
지원기관이 지원금액을 어디에 사용했는지에 대한 사용처와 관련된 세금계산서를 발행을 요구하지 않고,
지원기관을 공급받는 자로 세금계산서 발행을 요청했다면,
지원기관에 그 이유에 대해서 문의를 해보시는 게 좋을 것 같습니다.
부가가치세법에 "직접 관련되지 아니하는" 이라는 단서때문에 발행을 요청할 수도 있는 내용이 있어서, 해당기관에 문의를 해보시기 바랍니다.