공동명의로 진행하는 경우 건강보험료가 추후 지역가입자로 전환되며, 종합소득세는 두 공동사업자 모두 사업소득을 기준으로 부담하게 됩니다.
반면 단독명의로 진행하는 경우 건강보험료를 즉시 직장가입자로 가입하여야 하며, 종합소득세는 대표는 사업소득, 근로자는 근로소득으로 부담하게 됩니다.
또한 단독명의로 진행시 음식점이 일반과세자로 전환되는 경우 간이과세자인 기존의 사업장 또한 일반과세자로 전환됩니다.
부가가치세 측면에서는 공동명의가 유리하므로, 이외 종합소득세 및 건강보험료 측면에서는 수입규모 및 재산 보유현황에 따라 달라지므로 종합적으로는 말씀하신 내용만으로는 어떤 것이 유리하다 판단하기 어렵습니다.